巴拿马运河在巴拿马水运业中起非常重要的作用，每年大约有超过万艘来自世界各地的船舶经过这条运河。依靠运河带来的交通优势，巴拿马在运河大西洋侧附近建立了科隆自由贸易区。目前，该自贸区已成为中国往中美洲乃至整个拉美转口贸易的枢纽。
空运
巴拿马是拉美地区空运中心之一，全国有近250个大小机场和停机坪。图库门国际机场（原名奥马尔·托里霍斯机场）是巴拿马最大的国际机场，1947年6月1日启用，位于巴拿马城以东11公里处，日均起降400多架航班，旅客吞吐量万人，目前已经开辟了通往拉美、欧洲和亚洲39个国家（地区）、89个城市的航线，成为连接南、中、北美的重要航空中转站。2019年图库门国际机场旅客吞吐量1658万人次，其中约七成为中转旅客。因受新冠肺炎疫情影响，2020年图库门机场客流量为450万人次，同比减少%。新航站楼预计2022年投入使用，年旅客吞吐能力将可达2500万人次。
中国与巴拿马之间尚无直航航线，需要经由美国或者法国、荷兰等欧洲国家中转。
社会
教育
巴拿马政府重视发展教育，致力于提高国家的教育质量和国民的教育素质，规定每年国内生产总值的6%用来发展教育。据联合国教科文组织数据，2018年巴拿马成年人识字率为%。巴自1995年起实行11年义务教育，包括学前教育、6年小学和3年初中。2017年全国教育支出亿美元，占社会性开支的％。著名高等学府有巴拿马大学、科技大学、圣玛丽亚大学等。截至2015年底，全国共有教师68582名。