巴林同邻国卡塔尔有领土纠纷。1986年底双方曾因法什特迪贝尔珊瑚礁群岛的主权归属问题发生武装冲突。经海湾合作委员会成员国调停，1988年双方同意协商解决领土争端。卡塔尔于1991年7月向海牙国际法院提起诉讼。8月，巴林外交部发表声明，呼吁召开卡塔尔、巴林和沙特阿拉伯3国委员会会议，以求友好解决，或两国联合提交国际法院裁决。1992年4月16日卡塔尔发表40号埃米尔令，宣布“卡塔尔领海为12海里”，17日巴林发表声明予以拒绝。
国际立场
伊朗核问题：主张中东、海湾地区无核化。一方面认为伊朗有和平利用和发展核能的权利；另一方面，希望一切核活动应置于国际原子能机构的有效监管下，并确保限于民用。对伊核问题升级表示担忧，强调该问题应通过联合国安理会及国际原子能机构的调解得到最终和平解决，认为任何极端的解决方式都将使本地区陷入灾难。
伊拉克问题：认为一个统一、稳定、拥有主权的伊拉克是中东地区实现和平的基础。主张联合国在伊战后政治安排上发挥主导作用。支持伊政府为实现民族和解采取的措施，要求停止暴力和乱杀无辜，认为外来干涉是造成武装袭击的根源。
中东问题：支持中东和平进程，主张全面、公正、持久地解决阿以争端。要求以色列全面执行联合国有关决议，归还阿拉伯国家被占领土。主张建立巴勒斯坦国。认为哈马斯通过合法选举获得胜利代表了广大巴勒斯坦人民的意愿，其结果应得到各方尊重和认同。希望巴领导人克服分歧，组建民族团结政府。支持在阿盟有关决议和框架内向哈马斯组成的巴新政府提供财政援助。
对外关系
巴美关系
两国关系密切，巴系美非北约盟国。美国是巴林重要贸易伙伴。巴主要向美出口铝锭、铝粉、氨、服装及其他工业产品。巴从美主要进口汽车、汽车配件、轮胎、发电机和其他科技产品。美在巴注册的商业机构达830多家，在巴设立的分公司也有50多家。1999年2月美巴签署了两国投资保护协定，巴成为与美签署类似协定的第一个海湾国家。2004年9月，巴美正式签署自由贸易协定，2006年8月1日起实施。2006年，美商务部长古铁雷斯、副国务卿罗伯特等访巴，巴王储萨勒曼访美。
巴英关系
同英国有传统的交往。2006年，巴国王哈马德、王储萨勒曼、首相哈利法、外交大臣哈马德分别访英，英外交事务国务大臣豪厄尔斯访巴。
巴卡关系
巴林与卡塔尔对两国海域间的哈瓦尔群岛和卡塔尔半岛上的祖巴拉地区的归属存有争议，两国为此曾兵戎相见。卡主张将争端提交国际法院裁决，国际法院于1995年2月受理此案，但巴方表示反对并抵制了随后在多哈举行的第17届GCC国家首脑会议。后在沙特等调解下，两国紧张关系趋缓。1999年底2000年初，巴、卡两国元首实现互访，双方就理顺两国关系、尽快实现两国一体化达成共识，并决定成立以两国王储为首的最高混委会，互派大使，卡还开通两国直航。2000年2月，卡王储贾西姆访问巴林，并主持了两国最高混委会首次会议。4月，巴林王储萨勒曼访卡。同月，两国互派大使到任并递交了国书。5月，国际法院就卡巴领土纠纷举行最后一次听辩会，两国关系又出现龃龉。2001年3月16日，国际法院就巴、卡争端做出最终裁决，基本维持了两国边界现状，将巴方要求的祖巴拉地区仍属卡，卡方提出领土要求的哈瓦尔群岛仍划归巴，若干小岛重定归属，并明确划分了两国海上边界。巴、卡均表示接受裁决。2021年1月，与卡塔尔恢复全面外交关系。
巴中关系
1989年4月18日与中国建交。建交后，两国关系发展顺利。巴首相哈利法（2002年）、国王夫人赛碧凯（2002年）、副首相兼外交大臣穆罕默德（2004年）等访华，巴外交大臣哈立德来华出席中国－阿拉伯国家合作论坛第二届部长级会议（2006年），首相哈利法出席南京第四届“世界城市论坛”（2008），国防国务大臣谢赫穆罕默德（2009）和国家安全局长谢赫哈利法·本·阿卜杜勒·阿勒哈利法（2009）分别对华进行正式访问，文化大臣谢赫梅来华出席中阿文化论坛、上海世博会开幕式（2010）、外交国务大臣尼扎尔来华出席中阿合作论坛第六届部长级会议（2010）、工商会zhuxi伊萨姆访华并出席第108届广交会（2010）等。
与伊朗关系
2016年1月4日，巴林宣布与伊朗断绝外交关系，并责令伊朗外交人员在48小时内离境。
与以色列关系
2020年10月18日，巴林与以色列签署联合公报，正式建立全面外交关系。