在大明铁甲舰和披甲木舰组成的混合舰队的监督下，洋人真的保持了相当程度的控制，只有英国派遣了一艘蒸汽船在长江上巡航，保护往来船只的安全。法国舰队更是直接趴窝在外滩上，他们连租界都失去之后，在上海已经没有了固定的基地，法国商人也大多进入英美公共租界做生意，老实说，他们介入战争的兴趣本身就不大。大明主要是防备法国人借机找回过去失去的利益。
但法国人没有在上海闹事，他们却选择了在大明的南方，在越南闹事。
9月份，长江一带的激战持续不断的时候，法国向越南提出允许他们在红河上自由通航的要求，被越南朝廷拒绝，法国就让商人让·杜布依雇佣人员私自进入红河，试图寻找到一条通往中国云南的通道。
让·杜布依所带的人在红河上，被越南政府炮击，导致多人受伤之后，法国殖民政府打着调停的幌子，派弗朗西斯·加尼尔将军带舰队前往北方，调停当然只是一个名义，这个弗朗西斯·加尼尔本人正是西方所谓的红河航道的现者。
1866年他组建了一个庞大的调查团，从湄公河流域一直率队深入中国的云南、四川，再沿长江至汉口，于1868年6月到达上海。经过两年勘察，他向殖民政府呈交报告，证明湄公河不适于通航，并指出滇越的贸易的通道应为红河。
他因此次勘察所作贡献，在187o年被英国皇家地理学会授予金质奖章，同时他的报告也引起了法国人对红河的兴趣。要不是随后爆了普法战争，可能法国在红河的扩张早就开始了。
值得一提的是这个弗朗西斯·加尼尔，正是中国历史书中的安邺，后来被刘永福带领的黑旗军打死在桂越边境。