由于大明没有参战，所以法国始终掌握着水路，他们物资充足，消耗得起。但他们的兵力有效，防守河内的部队经过多次增兵，也不过三万多人，再多的人放在这里，法国自己的补给就要出问题，在优先保证镇压中圻乡绅起义的情况下，法国认为河内的防守是稳固的，但他千算万算都算不到，阮福明那个瘪三竟然还能弄来重炮。
最后解决问题的不是重炮，尽管河内几乎都被重炮夷为了平地，但法军依然死守，让他们选择放弃的是，对方的坑道挖到他们的要塞和战壕组成的防御阵地前，用爆破的方式，将他们的阵地突破了。
法国人不愿意在对方兵力优势的情况下，与对方进行短兵交战，于是主动从河内撤退，一路从水路，一路从陆路，退往了海防。
占领河内之后，越南王师没有继续追击法军，而是在河内就地休整，之后他们不打算沿红河追击法军，而是直接往南，他们打算进入清化、义安等省，跟那里如火如荼的乡绅起义取得联系。
时间进入1866年，更多的乡绅开始举兵，兴安省阮善述领导芦荡起义，清化省宋维新领导雄岭起义，清化省范澎领导巴亭起义，其中阮善述的起义军，活动范围很广，包括兴安、海阳、北宁、陆南等省都有的起义军身影。
值得一提的是，这些人都是越南官员，是地方上最富有影响力的官绅，很显然他们的起义跟广東境内当时对抗英法联军的乡绅团练是一个性质，因此可以将这些官绅的起义，看作越南的士大夫抵抗运动，跟中国明末、宋末时期，地方乡绅组织的义兵没有区别，这就是文化上的一致性。
这种由乡绅，甚至官绅阶层领导，有组织性的起义，显然比普通百姓的反抗要更有效，历史上潘廷逢的起义一直从1885年持续到1896年，直到他死后才结束，历史十一年。阮善述的起义，从1886持续到了1889年，历时三年。范澎领导的起义持续了一年。宋维新的起义持续了六年。
就像历史上的美国人一样，只要越南的民间反抗力量真正被激发出来，虽然不可能正面打击到法国人，但会把他们拖的精疲力尽，最后狼狈退出的。
历史上的法国之所以能够统治越南，是他们吸取了在广東的教训，知道能统治中国人的只有中国人，同理，能统治越南人的也只有越南人，所以他们很聪明的保留了越南国王，在对付民间力量的时候，就让越南小朝廷出面，以越制越，这一点上，受中国文化影响的东亚民族，跟更容易屈服的印度民族截然不同。
可现在，法国人面对一个十分不利的局面，那就是越南国王不再他们的控制之下，而基本上被大明所控制。
其实从阮福明到河内的那一刻起，法国在越南的殖民就已经注定不会成功了。
更不利的是，法国人还被阮福明，或者说大明政府欺骗，在越南发布了承认阮福明的合法性的公告，他们之所以这么做，第一是给阮福明展现诚意，第二则是认为一旦他们宣布废除自己拥立的同庆帝，能够很大程度上削弱当地乡绅的敌意。
谁知道他们率先展现了诚意，阮福明却不认账了，大明这个号称东亚最文明的国家，竟然不顾国际外交规则，不肯承认他们自己签订的条约，要知道如果不是大明参加谈判背书的话，法国很可能不可能答应单方面率先废除同庆帝。