林守与岑玉卿开坛，联手演算，终于算出果然还有幕后之人，那人在南疆塞外。
于是真相就不言而喻了，策划一切的是在数百年前早已被赶到极南之地的巫蛮首脑。
除却了内部隐患，五皇子为了安抚群臣，最终没有登基，只是代为涉政，此时局势虽然同样艰难，但渐渐清晰，就是北边的大乾政权与南边的反叛势力对垒。
唯一的变数在西域那些独立的妖族土司。
林守知道，无花和尚与那个狷寺有着千丝万缕的联系，推测其肯定在西域，于是亲自前往做说客，想请他带领西域加入己方阵营。
他找到和尚之后，对方却表示拒绝，就在僵持的时候，一个神秘人物出现在了西域，无花和尚显得很是警惕。
林守得知，神秘人正是巫蛮首领烛阴（人名）。
两人在西域大打出手，举手投足呼风唤雨，林守见势不妙，直接熘了，最后双方未分胜负，各自退却，无花和尚依然独善其身。
战事激烈，烛阴现身后，展现出强绝的力量，很明显，他和无花和尚是独一档，远超天下九境的其他高手，连岑玉卿都不敌，在平生会复生死者的帮助下，大乾朝廷行将入土。
无花和尚见朝廷要败，终于下场，将局势扳平。
过程中，林守突破九境，同样超过一般的九境，但比不上烛阴和无花那一档，他发现自己的妖修手段与小青极为契合，协助她也到了九境，
最终，双方兵马集中在了大乾最中央的地区一决死战。
林守小青和无花和尚一起，渐渐压制住了烛阴，眼看要将其击杀，然而烛阴落败之前却说出来最后的秘密。
最初，世上一共有四族。
巫妖人佛。
这四族里，有四个始祖，巫擅诡道，妖擅感悟天机，人擅杀伐，佛融汇万法，由于特性，佛门与另外三族联系渐深，自己却逐渐消失了，又或者说，三族之中，都有佛族血脉。
这四位始祖是天下强绝之人，所谓九境之上，长生不死，超脱凡俗。
但四人都不是什么好东西，总觉得卧榻之畔岂容他人憨睡，有几个邻居在，自己早晚不安全，所以明争暗斗，总想消灭其他人，但是由于力量太强，做不到。
最终，巫族始祖找到了办法，就是通过术法将对手的力量分离。
林守明白了真相，自己就是当初那个妖族始祖，在数百年前被分成了两部分，其一是身为妖族的小青，其二则是擅长演算天机的自己。
数百年前更早的时候，妖族始祖就算到了可能发生的危险，他提前布局，建立了无剑观，将自身气息隐匿在白玉莲花和红玉莲花之中，交代后人，遇到小青这样的情况，就要将莲花尽数交出。
但由于与另外三位始祖平级，所以算不清楚，还是着了道，被一分为二，作为妖的部分转世成了小蛇，人的部分成了林守。
如果按照最初的计划，两者依然是要合二为一的，可是妖祖再如何算也算不出来一个变数，那就是来自异界的穿越者。
另一头，人族始祖见到了妖族这边的下场，为了躲避巫蛮暗下黑手，选择了另一条路，夺舍转生，他走出幕后，建立了大乾王朝，所谓的皇族真龙血脉只是个幌子，之所以每一代都会出一个九境，那是因为他们统统都是同一个人。
而这一代，在巫祖的算计下，国师暗中下手，让人皇的夺舍出了岔子，他只把意识转入了五皇子的身躯，修为力量却留在了老皇帝的身体里，达到了一分为二的目的。
最后剩下的那个佛祖，也就是无花和尚，之前狷寺的所有大能高僧，其实都是他，转换身份只是为了掩人耳目。
巫族只要将他也“分”了，就能达到目的，成为天下唯一的最强。
和尚也不傻，他见局势不妙，决定与被分掉的妖祖，也就是成长中的林守联合。
唯一的问题是，和尚不会演算（会普通算，但跟妖祖比起来就是弟弟，所以等于不会），所以他担心自己去联合也是妖祖早就算好的，所以他在于林守相遇之后，故意作出了一个严重违背本心的举动，将天机演杀教给林守。
哪怕他知道这就是妖祖特地留在无剑观的，但他觉得，只有与本心反着来，才有可能是不被算计的。
殊不知，妖祖的算计从林守穿越的那一刻就已经落空了，现在的事态超出任何人的预料。
如今，人皇的实力只剩个空壳，巫佛两边对峙，林守不想叫任何一方获胜，否则剩下那一方，必然还是会消灭自己。
但是他们在前方对峙时，五皇子（人皇的精神）趁三方无暇分心，回到了皇宫重新夺舍，取得了躯壳（人皇的实力），导致林守反而成了弱势一方，因为他和小青是分开的，不如从前妖祖的鼎盛状态。
于是新的三足鼎立形成，整个天下都成了战场
林守返回南原道，守护亲友的同时，整日演算局势，无论怎样，都算出自己是败局。
但是他的演算有个问题，他算不了平级的另一个自己，也就是小青，蛇妖却心有所感，通过瑟瑟的方式与他合二为一（其实本来想的是小青牺牲自己，但既然都放大纲了，就不膈应人了），重新取回了九境之上的实力，并且额外还有一个优势，就是身为穿越者，不受此间天道压制，高出了原本的界限。
他在三败俱伤之时出来收拾了残局，他选择哪一方，哪一方就能获胜，又或者自己称王也可以。
最后林守独自镇压了三方，夺取了他们九境之上的那部分实力，但没有杀掉，巫族失去了诡道之术，不能再唤醒死者，他们回到关外，与大乾签订条约互不侵犯，和尚不再长生，到西域去坐镇狷寺，自治西域，五皇子失去了夺舍的能力，登基加冕，治理天下。
林守成了唯一拥有九境之上实力的人，他将自己势力分别交给三人，吴甲处理生意，申无良管理武力，离九负责监察。
之后自己带着宋小婉和小青在共济堂，重新开起了药铺。
完。