虽然比司农低了半级，但是能直接就给到了了孙思邈真人这个头衔，专管全国医事，说明李世民还是对孙真人有心的。
另外太医署改名大唐天医院，有医司直接负责，天医院院长，巢元方，也提拔到了四品官的地位，以后专门培养医学生，同时修书编典，进行学术研究也在这里。
那些来京城编修药典的名医老头，直接封为“医博士”“教授”，也有八品官身。
培养出来的医学生，如果顺利毕业，拿到执业医资格证，便可以输送到各县各府去，俸禄由地方财政拨款，也是有官身的。
主要职能就是防治瘟疫，在地方收编民间医生，还有药方，控制药物价格，研究地域性疾病……
而医科科举，也就是考执业医资格证书，不由朝廷举办，直接由大唐天医院举办。
至于太医院，本身职权没有变化，服务于皇室，达官贵人，经费由皇室拨款。
而尚药局，则是作为制定医药行业标准，药材价格，研究药材药性变化，实验功克瘟疫的方子，研究药材的种植，改良药材的炮制方法的综合性学习中心。
而每府、州设立“疫所”，“府医院”，两个机构，从大唐天医院毕业的学子就是输送到这些地方去。
疫所专门针对瘟疫，州、府医院则是一府，一州，医学之中心。
县也是一样，设立疫所和县医院，是一县之中心。
一旦发现瘟疫，层层上报，上传长安。
至于行政机制，也设立了，但只是辅佐司医运转，比如一些主簿啊，典历啊。
整体来说医司并不参与朝廷政议。
所谓在其政，谋其事，不越规矩就是。