回到京城，秦元清也开始投入自己的工作中，这一次水木大学是8月15日新生报道，8月16日军训，一直军训到9月30日，军训时间长达一个半月，也创下水木大学军训最长记录。
之前秦元清提议，延长军训时间，改变军训方式，锻炼新生的体魄、爱国情怀，经过激烈讨论后，获得了通过，而秦元清将作为2012年新生军训校方负责人。
根据计划，军训前半个月是在学校进行的，之后一个月转移阵地，到军营之中军训，军训可不仅仅局限在战军姿和正步走、齐步走，而且还会加入打靶训练、行军训练、演习训练、爱国主义教育。
他的助手们早已联系好军区，准备好一切，毕竟今年本科新生足有3300人，1186位女生、2114位男生，说实在的人数并不少，特别是转移阵地，所需的车辆可不少。
而且为了避免教官与女生出现乱七八糟的事，这一次军训也作出了调整，男教官训练男生，女教官训练女生，就是军营都分开，免得男人荷尔蒙分泌太过浓郁，搞出大新闻来。
虽然还没开学，但是秦元清就与军区的领导进行协调沟通，这一次军训可以说是一次很大的改革，军方也非常重视，也想趁机摸索探究，若是能让水木学子对军队感兴趣，然后参军，那就再好不过了。
华夏其他方面在改革，军队也不例外，信息化、现代化等等可都是需要高素质人才，所以军队对于大学生参军是有非常大的政策的，大学生一参军，那就是连级干部，可以说比普通人参军十年、二十年还要高，那是专门作为干部培养的。
这一次水木大学新生军训，一律都是请野战军进行军训，而且能当教官的都是得过荣誉的，很显然军队也很重视，专门组成了教官队伍，领队的还是一位上校。
秦元清在会议上再次强调此次军训的变革，是属于摸着石头过河，让教官们不用有什么负担，将新生当作新兵去训练。