宣徽院这一在大明朝成为国家文史部门的存在在改制之后裁撤编制，所属成员全部归于学部下设文史司。
内侍管理部门和属于皇宫维护的一系列部门组织全部裁撤，所属宦官、宫女全部按照苏咏霖之前的规定妥善安置，结束存在的历史。
于是原先大明国的朝廷系统完成了内部统一，只留下一个尚书省。
尚书省下辖工部、学部、财政部、民政部等诸多部门，总揽全部行政事务，是大明国的中枢行政机构，直接向民众代表大会负责。
司法系统的大理寺、都察院和法部从来独立，本身就是一个独立的系统，不受其他任何部门钳制，原先直接对皇帝负责，现在也是直接改为向民众代表大会负责。
军事系统和复兴会系统在之前就被苏咏霖做了一番改动，这一次大会上则是直接赋予其法律上的合法意义。
原先军事系统的参谋总部和复兴会军务部合二为一，成为全新的军事部，负责全国军队的管理和指挥，枢密院则维持原有编制不改动，是全军后勤部门。
军事部和枢密院原本直接向皇帝负责，改制之后，也全面向民众代表大会负责。
复兴会系统是较为特殊的存在，是苏咏霖在之前的年代为了对抗封建旧思想的先锋力量，对国家发展有着极为重要的贡献，也因此，其行动有着一定的独立性。